O programa desenvolvido no Depto. de Pediatria do HC-FM Botucatu- UNESP, enfatiza a importância do aprimoramento profissional para o trabalho com crianças e adolescentes e divulga a importância do PAP na formação profissional pós-graduada dos profissionais da área de Serviço Social, Nutrição e Biologia. Os programas são: Imuno-patologia Pediátrica; Análises Clínicas-Gastro-Hepatologia Infantil; Nutrição Clínica em Pediatria e Atenção Integral à Saúde da Criança e do Adolescente.

O Laboratório Experimental de Pediatria possui uma área de 154,3m quadrados totalmente reformulada quanto a sua estrutura e infra-estrutura através de verba de auxílio à pesquisa da FAPESP para "Readequação do espaço físico e da infra-estrutura da área física". Neste espaço temos um laboratório central e salas para equipamentos básicos, equipamentos a gás, lavagem de material, preparo de material, almoxarifado, pequenas cirurgias. Externamente temos biotério-enfermaria. Conta com equipamentos como Cromatografia líquida de alta resolução (FAPESP Infra IV) e Espectrofotômetro de absorção atômica com forno de grafite, freezer -85ºC, espectrofluorômetro e espectrofotômetro UV. Esta infra-estrutura tem permitido aos pós-graduandos participar da montagem de métodos de laboratório, tais como: determinação de carboidratos e de vitaminas (A e E) por cromatografia líquida de alta resolução; determinação de Selênio por espectrofotômetro de absorção atômica, bem como desenvolver técnicas de produção experimental de colestase. Também desenvolver habilidades no trato com animais de laboratório.
A implantação da pós-graduação foi decisiva na melhoria da infra-estrutura do laboratório de pesquisa, bem como na qualidade das pesquisas efetuadas.